自然氣首先進入進料布氣腔，氣體撞擊在支撐濾芯的支撐管（防止氣流直接衝擊濾芯，形成濾材的提早損壞）上，較大的固液顆粒被初步別離，並在重力的作用下沉降到容器底部（定期從排汙口排出）。接著氣體從外向裏經過過濾聚結濾芯，固體顆粒被過濾介質截留，液體顆粒則因過濾介質聚結功用而在濾芯的內外表逐步聚結長大。
當液滴抵達一定尺寸時會因氣流的衝擊作用從內外表零落出來而進入濾芯內部流道然後進入匯流出料腔。在匯流出料腔內，較大的液珠依托重力沉降別離出來。此外，在匯流出料腔，還設有別離元件，它能有效的捕集液滴，以避免出口液滴的被夾帶，進一步進步別離效果。
最後幹淨的氣體流出過濾別離器。隨著燃氣經過量的增加，堆積在濾芯上的顆粒會惹起燃氣過濾器壓差的增加，當壓差上升到規則值時（從差壓計讀），闡明濾芯已被嚴重梗塞，應該及時改換。過濾別離器的改換條件，壓差到達報警極限，運用期限超越半年，濾芯破損（壓差忽然降落）過濾別離器的啟用。
別離器在運用之前，做一次全麵的檢查，確保別離器處於完好的狀態。關閉放空閥，翻開壓力表的儀表閥。翻開別離器的上遊閥門對別離器停止充壓，閥門兩端有均衡閥時應首先運用均衡閥遲緩像別離器充壓，使別離器內壓力穩定後，再全開進口閥門，關於過濾別離器，別離器內壓力穩定後，翻開過濾別離器上的差壓表。留意：先開差壓表的均衡閥，在開均衡閥的左右閥門，以免差壓表損壞。
